在中共山东省委和泰西特委的领导及各县委的支持下，新建成的八路军山东纵队第六支队全体指战员，不负泰西人民的众望，以昂扬的斗志和必胜的信心，投入新的更加激烈、残酷的斗争。

这次自卫团的改编，是泰西地区我党领导下的游击队历史性的跨越，不仅使这支地方武装力量纳入八路军山东纵队的战斗序列，更重要的是标志着这支武装开始由一支地方游击队向更加正规和领导有力的主力部队转变。同时，也泰西地区抗日武装力量建立和发展有了更坚实的基础，泰西地区的抗日斗争也进入了崭新的阶段。如何使这支泰西地区发展起来的武装力量，在党的领导下尽快成长为一支有组织、有纪律、有战斗力的部队，日益成为一项迫在眉睫的工作。

此时的泰西地区的抗日武装力量虽已编入山东纵队战斗序列，但部队成员的主要成份，却依然是以我党在泰西武装起义时组织的游击队为主，省委及中央派遣来部队的红军骨干、党员及进步教师和学生占有比例极低，大部分是本乡本土的农民以及改编的地方保安队等。由这些成员组成的游击队，在日军入侵、国土沦亡之际，揭竿而起，保卫家乡，抗击敌人侵，表现出极高的抗日热情和不屈不挠的斗争勇气。但在斗争中，也暴露出了部队组织纪律性不强、战斗力不强等方面的问题。这些问题，亟待解决。

1939年初，山东纵队成立不久，即提出了对所属部队进行全面整顿的要求，并制订了第一期整军计划。3月初，八路军一一五师直属机关及六八六团大部以东进支队名义挺进山东，抵达泰西。3月14日，东进支队在东平常庄与泰西地委、六支队会合。师部与直属队伍驻常庄、徐坦一带，泰西地委机关随师部一起活动，六支队驻东平马庄，六八六团驻肥城城南尚任一带。根据师部命令，原华北冀鲁边七团开抵泰西，进行整训。鲁西区党委机关与津浦支队经由大峰山区赶赴常庄与一一五师会合。

一时间，肥城南部及东平北部山区集中了﹣﹣五师机关及部队，鲁西区党委、泰西地委及六支队，津浦支队、冀鲁边七团等机关、部队。

为尽快打开泰西地区抗日斗争新局面，罗荣桓建议由鲁西区党委机关和泰西地委组织一次党的会议，以便迅速向泰西地区党的组织和部队传达中共中央扩大的六届六中全会精神。3月20日，泰西地委在东平四区常庄召开了"泰西地区抗日活动积极分子大会"。部队及地方党委负责人参加了会议，六支队营以上干部也参加了会议。罗荣桓向大会传达了中央扩大的六届六中全会精神和毛泽东同志的政治报告《论新阶段》。罗荣桓详细分析了抗日战争进入相持阶段后将会出现的新的斗争形势，指出：要根据中央巩固华北，发展华中的战略方针，及时调整战略部署，以适应抗战新局面的到来。他说："一一五师挺进山东，是执行中央的战略决策，开展敌后游击战争，建立稳固的山东抗日根据地。并明确提出要加强泰西抗日根据地建设，依托泰肥山区、大峰山区、平阿山区和东平湖，向四周发展，使之与山东各根据地连成一片"。为此，一一五师帮助地方党委、武装部队开展了建党、建政、整军等工作。

根据会议部署，一一五师与鲁西区党委、泰西地委、六支队研究决定，由一一五师司令部、教导大队，协助六支队进行整训，以全面快速提高部队政治、军事素质，增强部队战斗力，为积极开展武装斗争做好军事上的准备。

自4月份开始，一一五师司令部、政治部、供给部、教导处多次举办各种类型的学习班，为六支队及各县地方武装培训了大批军事指挥员、政治指导员、后勤供给员、锄奸特派员等。在这次整训中，六支队对部队建制进行了调整，各团取消政治处、参谋处、供给处及营一级设置，由团直接指挥连，将营职指挥员充实到连队，并对部队成员进行了调整，抽调一部分干部到地方从事建设政权工作。原六支队司令员刘海涛调离，由张北华任司令员。为加强六支队的骨干力量，一一五师选派一部分有经验的营连干部到六支队任职，在战斗中帮助六支队基层指挥员提高作战指挥能力。同时，加强部队基层连队党支部建设，吸收一批骨干加入党的组织，不断增强部队党员队伍的力量。大力开展红军光荣传统教育，提高部队干部战士的思想觉悟。经过短期整训后的六支队，军政素质有显著提高，进一步增强了部队战斗力。

6月，根据集总整军计划，山东纵队开始第一期整军，六支队在一一五师帮助下，进行第二次整编。司令员张北华调离，由何光宇任司令员，石新安任政委，团改营建制，一、二、三团改为一、二、三营（10月，三营改特务营，高塔拉任营长，张心田任教导员。冬，长清县独立营升级编为三营），泰安（西）独立团改为独立营；成立泰西地区自卫队司令部，肩负站岗放哨、捉汉奸、送情报、教育监视伪顽家属、保卫地方政权和群众利益、协助部队作战等任务，各县均成立了自卫队司令部；改编东汶宁支队，由东平县游击大队长陈本清任司令，六支队一营营长刘继星任副司令。为加强党对该支队的领导，-﹣五师派刘汉任政委，六支队派王少云任政治处主任。原六支队一营编为东汶反叛被处决，其二、三营被缴械）。宁支队一营，胡国军任营长，解抑峰任教导员；陈本清部编为二、三营（后陈本清意欲反叛被处决，其二、三被缴械）。

在一一五师帮助下，经两次整编，六支队增强了组织纪律性，克服了游击习气，战斗力进一步增强。六支队同一﹣五师一起活动，联营驻防，同开军民联欢会，一起唱歌，浩浩荡荡，朝气蓬勃。

自从﹣﹣五师进入泰西以来，整个泰西地区对敌斗争形势发生了显著变化，敌我双方力量对比随之改变。一﹣五师、津浦支队、冀鲁边七团以及六支队等作战部队均驻防于泰肥山区、东平一带，使我军局部力量处于绝对优势。在此期间，六支队配合主力部队，积极开展武装斗争，多次沉重打击日伪军。

3月16日，东汶支队（六八六团两个连及六支队一团组成）一举拔掉东平围里据点，毙俘伪军100余人，缴枪60余支。22日，又于郑海村击溃日军一部300余人。战斗中，六支队一团团长陈伯衡牺牲。

泰西军事斗争形势的发展变化，引起了敌人的极大恐慌。自5月初起，日军纠集山东主力作战部队及地方守备部队5000余人，对我泰肥山区党政机关及部队发起合围。5月11日上午9时，一一五师师部、鲁西区党委、津浦支队，以及泰西地委、六支队一部、六八六团等机关部队近3000人被敌人包围在肥城陆房一带。被围部队依托山地构筑工事，沉着应战，多次击退敌人进攻。战斗一直持续到黄昏。经过一天激战，我军指战员歼敌1300余人，并于晚间突出重围，顺利抵达东平无盐村。

陆房一战表明，我军还缺乏在平原地带开展游击战的经验。同时，由于泰肥山区狭小，大规模部队无法展开并实施机动作战。一﹣五师首长根据中央军委指示，决定师部机关、直属队大部向铁路东转移。师司令部组成轻便指挥机关，与六八六团转移至东平湖一带活动，六支队仍然坚持泰西地区武装斗争。

根据﹣﹣五师指挥部决定，六支队将部队化整为零，分别活动于大峰山区、泰肥山区和东（平）汶（上）宁（阳）平原地带。8月，六支队按照鲁西区党委会议部署，充分依靠群众，在肥城、宁阳、汶上等地开展了挖沟、破路、破围寨的"改造地形，创造战场"斗争，为开展平原游击战争创造对我军有利的游击环境。

8月，为加强对地方武装的领导，鲁西军政委员会决定，-﹣五师独立旅兼鲁西军区，六支队在东平县荣花树村召开首届部队党代表大会，总结建党、建军经验，提出新的工作任务。继而六支队将各县武集合于肥城境内进行整训，充实调整县独立营负责人，加强军政训练，使各县武装提高了军政素质。

9月，八路军一一五师根据集总命令，在陈光、罗荣桓率领下，开始向鲁南转移。同时，八路军东进纵队在肖华司令员带领下，由冀鲁边分批进驻运（河）东、泰西结合部活动。9月15日，为掩护驻东平二区一带休整的﹣﹣五师师部，六支队二营成功阻击了从东平、平阴进犯之敌800余人，打退敌人七次进攻，毙敌近百人，掩护一一五师部队安全转移。主力部队撤离后，泰西敌我斗争的形势随之发生变化，国民党肥城县长田家滨公然与泰西地委、六支队对抗，制造磨擦，并纠集肥城、东平地方武装，袭击抗日政权，绑架抗属，殴打群众，蓄意挑起事端，破坏抗战统一阵线。10月，泰西地委根据中共中央《关于山东工作方针》中"对顽固分子无理举动，以态度强硬为原则"的精神，指示肥城县委对田家滨展开坚决斗争。

六支队根据地委决定，派出三营协助肥城、长清地方武装，会同当地万余群众，将田家滨部驱赶出泰西地区。进入11月后，日伪军纠集宁阳、汶上、东平、东阿、肥城等地千余之敌，开始对泰肥、平阿山区我党政军机关、部队驻地突袭。六支队各部队与各地武装密切配合，与敌激战一周，成功击退各路进攻之敌，毙伤敌200余人，缴获步枪70余支，粉碎了敌人的"扫荡"。面对主力部队转移后出现的新的斗争局，六支队根据首届党代会提出的任务，及各县地方武装兵员不足，战斗力不强，急待整顿提高的问题，决定进行整顿。

1940年初，泰安（西）独立团与驻夏张泰肥独立营大部奉命合并改编成泰安（西）独立营，栗森任营长，吴涛任政委。2月初，一、二连升级补充一一五师教三旅九团，后又将地方区中队、回民大队等抽调补充独立营，为泰西独立一营；肥城独立营重新组建后，由王正南任营长，李文甫兼任政委，为泰西独立二营；长清独立营为泰西独立三营，王月亭任营长，张有壬任教导员；1939年5月，平阿基于大队已有队员300余人，先后发展组建两个独立营，一个营隶属六支队，后升级主力，后又组建泰西独立四营，马亚鲁任营长兼教导员；10月，按照上级命令，东平县基于大队改称东平独立营，展庆鲲任营长，刘仲羽兼政委。1940年2月改编为泰西独立五营，王课亭任营长，强仁普任政委；宁阳独立营改编为泰西独立六营，朱景璜任营长。汶（上）东县尚无基干大队，后成立汶（上）东游击大队，由县长张云峰兼任大队长。