西宁市东关清真大寺坐落于高原古城西宁市东关大街，是当地10余万穆斯林开展宗教活动的核心场所。作为青海省规模最大、历史最为悠久的清真寺，它与西北地区的西安化觉寺、兰州桥门寺、新疆喀什艾提尕尔清真寺等并称为西北四大清真寺。

相传，西宁东关清真大寺始建于明洪武年间。寺内《重建西宁大寺碑记》记载："创自明代，毁于兵燹"；另据《重建西宁东关大寺碑记》，该寺"创自明代，屡经兵燹，其地遂废"。

1961年编《西宁市志稿》亦载："西宁东关清真大寺相传由明将军西平侯沐英建议明王朝于洪武年间初次修建"。大寺初建时规模狭小、结构简陋，历经沧桑几度拆毁修复，方形成今日之规模。 

乾隆四十六年（1781年），苏四十三、韩二个领导回族、撒拉族民众发动反清起义。清军在镇压此次起义过程中，下令拆毁了西宁东关清真大寺。

清咸丰末年至同治初年，陕西地区数十万回族民众在白彦虎等人领导下，因不满清廷压迫揭竿而起，高举反清义旗。清政府急调湘军左宗棠部及甘肃马福祥部前往镇压。在清军重兵围剿下，起义军节节撤退，辗转抵达西宁。此时，原属起义军的西宁府知府马桂源与其兄、西宁镇总兵马本源对起义军深表同情，遂与之联合固守西宁。

同治十一年（1872年），左宗棠部攻破西宁城。次年（1873年）春，湘军部将、西宁镇总兵何作霖下令将刚重建不久的西宁东关清真大寺再次拆毁。

清光绪二十一年（1895年），甘青河湟地区回族、撒拉族民众在韩文秀领导下发动武装反清斗争，清政府遂命甘肃马福祥率军镇压。同年十二月至次年二月，“河湟起义”遭清军扑灭，已重建的西宁东关清真大寺再遭清政府拆毁，整座寺院被夷为平地，仅余几座柱石残存。清政府同时派员监督，严禁在原址开展宗教活动。

直至辛亥革命后，民国二年（1913年），青海各界各族人士为重建西宁东关清真大寺纷纷捐资，工程于次年（1914年）竣工。

1916年，因原大殿方位有误，遂将其全部拆除，从外地聘请工匠重新测定方位后进行扩建。1946年至1947年，陆续修建南北楼各两座、唤醒楼两座、水塘一座，以及饭厅、宿舍等80余间房屋，3间半铺面，西式大门及重门各一座。工程自民国35年开工，至民国36年4月竣工。至此，寺院规模宏大，格局焕然一新。 

新中国成立后，党和政府始终高度重视并充分尊重少数民族的宗教信仰自由。1949年9月5日，西宁迎来解放。仅时隔4天，即9月9日，西宁地区回族群众便在东关清真大寺内隆重举行庆祝大会，王震、廖汉生、王恩茂等同志亲临现场。

此后，朱德、陈毅、彭德怀等党和国家领导人亦先后到访该寺，其中陈毅同志还特意捐赠人民币1000元支持寺院建设。需说明的是，"文革"期间，东关清真大寺曾一度关闭，后被改称为"西宁市城东区劳动人民文化宫"。 

党的十一届三中全会后，随着拨乱反正工作的推进，西宁东关清真大寺于1979年6月19日正式恢复开放。1981年，省政府拨付8万元专项资金对寺院进行重新油漆粉刷，使其面貌焕然一新。

西宁东关清真大寺总占地面积超20亩，建筑总面积达4654平方米，整体建筑雄伟壮观，兼具中国传统建筑艺术精髓与伊斯兰教特色。寺院正门"前三门"为一大两小的绿色西式大门，高10米、宽15米，门顶横幅匾额镶有金光闪闪的"西宁东关清真大寺"8个大字。 进入"前三门"后，前行约30多米，在数十级花岗石台阶的台墩上，矗立着高近10米、宽21米的"中五门"——5座平顶拱形门排列其间。"中五门"南北两侧各有一座宣礼塔，庄严肃穆。

穿过"中五门"，南北两侧是两座老式木楼：北楼设有接待室、藏经室、会议室等；南楼则为阿訇进修班教室、学员宿舍及教研室。两楼之间是面积达4490平方米的开阔大院。

大院西侧，一座建在2米高石基之上的礼拜大殿格外引人注目。大殿建筑面积1136平方米，外形仿照明代"金銮殿"样式，采用砖木结构，外壁以大青砖砌成，虽历经岁月洗礼仍坚实完好。前廊两侧图案精雕细琢，屋顶覆以彩色琉璃瓦与小青瓦，殿脊中心的3个金黄色筒形宝瓶在阳光下熠熠生辉。

此外，大殿右侧设有阿訇、满拉的专属宿舍，南楼背面则规划有男女分设的沐浴室及殡葬室。

西宁东关清真大寺曾藏有诸多历史文物与珍贵史料。据老辈人回忆，大寺原址对面曾有一座碑亭院，专门记载寺院历史，院内立有十余座石碑，其中一座高逾一丈的红沙石碑尤为珍贵，镌刻着历代帝王圣旨及明太祖朱元璋御赐的“百字赞”。惜乎这些历史资料大多散佚，如今寺内仅存3座石碑：两座立于民国37年（1948年），为重刻的《重建西宁大寺碑记》与《重建西宁东关大寺碑记》；另一座是民国3年原刻《重建西宁大寺碑记》，碑面虽有剥落、部分字迹模糊，仍立于大殿左侧。

自西宁东关清真大寺恢复开放以来，西宁地区穆斯林群众的宗教生活全面回归正常。目前每日约有500余人按时到寺履行“乃麻孜”，主麻日聚礼人数约6000人，开斋节、古尔邦节期间参与会礼的信众更达15000余人。

寺院由13人组成民主管理委员会，韩生贵任主任，马相臣任教长，统筹寺院各项事务。寺内设有外宾接待室，仅1985年便接待外宾逾1000人次。