（溥仪童年像）

宣统三年（1911年），是陈宝琛人生的一个重要转折点。这一年，清廷下谕，取消了之前补授他为山西巡抚的任命，派他和陆润庠入毓庆宫“授皇帝读”，充任6岁的小皇帝溥仪的末代帝师。此后，他先后获赐紫禁城骑马、汉军副都统、弼德院顾问大臣等殊荣。陈宝琛这“帝师”一做就是二十年，即便溥仪逊位（1912年2月12日）后，他依然不离不弃，追随溥仪，奉命修《德宗实录》。民国十三年（1924年）十月，溥仪被逐出故宫时，见到陈宝琛，放声大哭说：“我无颜见列祖列宗！”

1931年，溥仪被日本侵略者诱至东北充当伪满傀儡。陈宝琛深知这其中的利害关系，他不顾自己风烛残年之躯，毅然冒死赴东北劝谏。他言辞恳切，声泪俱下地劝说溥仪不要陷入日本人的阴谋诡计之中。然而，溥仪此时已被权力冲昏了头脑，根本听不进陈宝琛的劝告。陈宝琛差点被日本关东军囚禁，无奈之下，他只能郁郁离开。但他坚守住了自己的民族气节，没有向日本人低头。

陈宝琛不仅是末代帝师，还是福建近代教育的主要奠基人。在他赋闲期间，始终心系家乡教育事业。光绪二十三年(1897)，他担任东文学堂(原苍霞精舍)董事兼总理。

戊戌变法后，东文学堂扩充为官立全闽师范学堂，全力培养适应新式教育的师资力量，他出任学堂监督(校长)。这所学堂也是全国最早创办的师范学校之一。他还撰写了一篇语重心长的《开学告诚文》，成为全闽师范学堂培养学生的准绳。

光绪二十五年(1899)，他任鳌峰书院山长。他大胆地对书院的教育内容和方法进行改革，以适应新时代的教育需求。他积极派遣或帮助学生前往日本留学，为晚清中国留学热潮的发展起到了推动作用。他还在鳌峰书院中创设女子师范传习所，由其妻王眉寿任监督，开创了福建近代女子教育的先河。

光绪三十一年(1905)，他当选为闽省学会(福建教育总会前身)会长。在他的带领下，学会众人齐心协力，福建各地掀起一股创办小学堂的热潮。到1909年陈宝琛复职内阁学士兼礼部侍郎时，福州各乡镇共创办了30多所公立和私立小学，新式教育在福州蔚然成风。在此期间，陈宝琛付出了大量的心血和努力。